유전자원에 대한 접근 및 유전자원 이용으로 발생하는 이익의 공정하고 공평한 공유에 관한 의정서. 2010년 일본 아이치현 나고야시에서 열린 제10차 유엔 생물다양성협약 당사국 총회(CBD/COP10)에서 채택돼 나고야 의정서라 불린다. 생물자원은 계속 고갈되는데 이를 이용하는 기업만 돈을 벌 뿐 정작 원산지 국가에는 이익이 제대로 돌아가지 않는다는 문제의식에서 출발했다. 2014년 3월말 현재 노르웨이 인도 멕시코 등 29개국이 의정서를 비준했다.한국을 포함, 44개국은 비준을 준비 중이다. 50개국이 서명한 비준서를 생물다양성협약 사무국에 기탁하면 90일째 되는 날 발효된다. 의정서가 발효되면 생물(동 · 식물) 유전자원을 채집·반출한 뒤 의약품·식량·신소재 등으로 이용하려는 나라는 유전자원 제공 국가에 미리 통보해 승인을 받아야 하며, 유전자원 이용으로 발생한 금전적 · 비금전적 이익을 사전에 합의된 조건에 따라 배분해야 한다. 나고야 의정서 채택으로 1992년 6월 생물다양성협약 이후 18년 동안 계속돼 온 생물 유전자원 이익 공유에 관한 논의가 마무리됐다.