의약품유통종합정보시스템은 의약품 유통체계 현대화와 건강보험 약제비 지불체계 개선 등의 추진을 위한 의약품 전자상거래 중개시스템이다. 병·의원의 주문 및 재고관리, 대금정산, 거래정보관리　등으로　구성된 시스템으로　의약품　유통체계 투명화 등을　위해　1998년　10월부터 추진됐다. 그러나 관련 법규의 미비와 제약사 및 병·의원의 참여 부진 등으로 정상 운영에 실패했다.