세금을 억울하게 부과 받았거나 세무조사 과정에서 부당한 대우를 받은 사람을 보호하기 위한 담당관제도. 납세자보호담당관은 ①중복적인 세무조사나 조사권남용 등으로 납세자의 권리가 부당하게 침해됐다고 판단될 경우 세무조사 중지명령 ②세무서에서 세법을 잘못 적용하거나 사실 판단을 제대로 하지 않는 바람에 부당한 과세가 예상되는 경우 과세처분 중지명령 ③위법. 부당한 과세처분이 확인될 경우 직권시정 요구 ④세금 부과 및 징수와 관련 서류 열람 등의 권한을 가진다.